从DeepSeek到科研图像处理：降本增效的必备秘诀
最近DeepSeek大模型举世瞩目，凭借顶级的性能和低廉的价格，震动了整个科技圈，也为整个AI应用生态注入了新的活力。可以说deepseek的模型完美地诠释了什么是来自东方的神秘创新力量，工程效率极致创新，物美价廉谁能不爱（openai能）。这开春，勤奋的导师们正开心地用DeepSeek改标书呢！
如今科研上的竞争也早已不再仅仅局限于比拼设备、实验时间，而是转向了数据量、结果质量和智能算法的高效运用。在这个AI时代，机器学习，高效算法，与图像处理软件的结合正在重塑科研图像处理领域。科研图像处理也可以降本增效。
有的课题组还在用传统手段计数阳性细胞，而另一些课题组则利用多组实验、多通道层扫图像时间序列（4D），实现了全面自动化分析和结果精准呈现。这种转变正预示着，科研竞争的关键已转向效率，数据数量和质量的较量。
科研图像处理的新法宝
在这样的背景下，掌握自动化和AI技术已成为科研图像处理领域的制胜法宝。为此，我们推荐2024年必学的四款核心工具——它们均搭载前沿AI技术，并能无缝结合开源软件ImageJ，帮助你倍增效率、提升成果质量。
1. Trainable Weka Segmentation (TWS)：万能分割框架，高效处理复杂图像
TWS是一款强大的图像区域分割插件，无论是细胞、颗粒、气泡还是纤维，只需简单几笔即可完成分割。传统的阈值法往往难以应对复杂背景下的图像，TWS背后的随机森林算法正是专治此类问题的利器。事实上，不少专门的插件（如用于肌肉细胞分析的Myosoft）都基于类似原理，实现了高效分割。
2. Cellpose：细胞分割领域的明星工具，轻松实现批量分割
自2020年以来，Cellpose成为细胞分割领域的“苹果”，多次登上顶刊（例如Nature Methods）。它不仅使用体验丝滑，而且无需编程经验，即装即用，分割结果还能自动保存为ImageJ中的ROI。尽管近年来出现了其他模型在某些特定领域具备优势，但Cellpose凭借其易用性和完善的文档，依然是细胞分割的标杆工具。
3. TrackMate：追踪利器，集分割与可视化于一体
如果你需要对时间序列图像进行物体追踪，TrackMate绝对是你的不二选择。作为ImageJ的经典插件，它集成了图像分割、物体追踪与数据可视化功能，并与多种机器学习插件（如trackmate-weka、trackmate-starDist、trackmate-cellpose）深度整合，使得追踪精度和适应性均达到了前所未有的高度。
4. Segment Anything (SAM)：万能分割模型，高效处理复杂图像
由META推出的SAM模型在短短一年内就获得了超过6000篇科研论文的引用，颠覆了传统分割模式。SAM以其出色的易用性和强大分割能力，在自动化图像处理上展现出巨大潜力，而今年新出的SAM2则将这一效率推向新的高峰，甚至能实现视频分割。在科研领域，SAM生态已经日益成熟，其衍生模型如MedSAM也正成为医学图像分析的利器。
【重磅推荐】三天速成AI图像处理训练营
看到这里，说明你一定是一个好学且追求科研突破的人！机会来了，ImageJ资深专家，B站知名up阿图老师亲自下场，组织学习以上所有核心工具，两周训练营带你学习掌握AI科研图像处理，科研能力跃升到一个全新高度！
为期两周的AI 图像处理训练营， 为新年开一个好头！
这个训练营是阿图多年积累的经验精华，上百个硕博和青年导师曾找我咨询，最高客单价甚至达到 5 位数，有的课题组已经用这些技能发论文拿下顶刊。
在训练营中，你将学到：
- ImageJ 宏语言在自动化中最简单高效的用法。
- 如何利用TWS实现快速且高精度的自动化图像区域分割，并实现GPU加速；
- 用Cellpose轻松批量处理细胞分割任务，并将结果无缝转化为ImageJ中的ROI；
- 借助TrackMate实现时间序列图像中的精准追踪与数据可视化；
- 如何运用SAM及其衍生模型解决复杂图像分割难题。
以下是AI图像处理训练营课程大纲：
（第一周）第一节 – AI图像处理的基础：
• 数字图像处理的初衷
• AI图像处理的发展
• ImageJ宏语言的入门
（第一周）第二节 – 图像分割神器TWS 基础
• 随机森林和TWS原理
• TWS实操与预处理
• 多张图像的训练方法
• AI超分辨和上转换的图像预处理
• 自动化：预处理+TWS分割+后处理
（第一周）第三节 – 图像分割神器TWS 自动化实战
• 项目实战：自动化分析多张复杂图像
• TWS API 更快更好地自动化
• TWS-trackmate 应对目标追踪
• TWS 处理大型图像和GPU加速
（第一周）复习与答疑
（第二周）第四节 – 细胞分割Cellpose基础：
• Cellpose系列论文浅读与原理介绍
• Cellpose安装与实操
• Cellpose自动化分析多张图像
（第二周）第五节 – 细胞分割Cellpose实战
• 项目实战：Cellpose批量分析运动细胞
• Cellpose + TWS 结合的自动化方案
（第二周）第六节 – 分割一切模型SAM
• Segment Anything Model 与SAMJ
• MedSAM在3D分割中的应用
• SAM2视频分析简介
（第二周）总复习与展望
（第二周）交流答疑
上完课后，拿到成堆需要处理的图片后，你将能够：
• 快速找到最实用的工具：简单易学，方便安装，轻松上手，无需编程基础。
• 掌握清晰的处理步骤：遇到难题时，知道如何逐步尝试不同的方法，直至成功。
• 轻松掌握自动化技巧：熟练操作每个自动化处理工具，让批量分析变得快捷高效。
课程适合的人群
- 科研行业的职场一族，想要 更新技能，领军项目，升职加薪 ！
- 熬夜处理图像的高校学生，正在 毕业赶due ，想要 提高效率 ，发表论文！
- 对图像处理饶有兴趣的朋友，闲暇时间想 学点技巧 ，赚点外快！
下面是第一期训练营的部分真实反馈，可以看出阿图是尽心尽力争取帮助到往届学员的科研，学业，项目和团队，如果能通过训练营与你相识，和你建立长期的合作关系，为你的项目带来价值，将是阿图莫大的荣幸！
以下是课程信息
讲师介绍：Bilibili图像处理区知名up主
思语视觉创始人 - 阿图老师思语视觉的个人空间-思语视觉个人主页-哔哩哔哩视频
开营时间：2月15日- 16日；2月22日 – 23日
无法参加的同学无需担心，课后会发送录播和课程视频观看。
适用范围：细胞数量与形态分析，荧光分析，荧光点分析，晶体分割，粒径分析，各种其它图像实例分割与数据分析物体，细胞追踪
课程价格：
- 价值2899 的训练营 + 价值998的录播课视频 + 价值 149的付费群 + 1500元 1v1咨询一次。
- 为了保证教学质量和深度交流，本期限定20个名额 。
- 2月10日前报名，以上所有只要2588（总价值超5500元)！2月10日以后报名5500元。
- 3人团购85折（2198元），5人团购75折 （1948元）
- 对课程不满意，并对1v1咨询结果也不满意的，可全额退款！
可开发票方便报销。发票种类：会议费，技术咨询，技术服务，计算机及系统销售、计算机视觉硬件及辅助设备销售、办公自动化设备租赁，软件开发等。
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