『零基础』ImageJ图像处理 - 精讲测量分析结果 (set measurements)

ImageJ里面主要的测量方式是measure和analyze particles。这两种方法所得到的结果的数据测量种类都由set measurements来得到。这一期就来好好讲讲set measurements里面有那些内容。这一期是这个系列的上集,主要针对强度,大小测量和几何形状测量的内容,下一期会介绍强度分布的一些测量,希望给大家带来帮助。

关于set measurements的官网英文解释链接:

https://imagejdocu.list.lu/gui/analyze/set_measurements

以下是中文翻译:
设定测量…

使用此对话框指定由“分析/测量”和“分析/分析粒子”记录的测量值。

设定测量对话框

  • 面积(Area) - 选择区域的面积,以平方像素为单位。如果使用“分析>设定比例”对图像进行空间校准,则面积以校准单位(如平方毫米)表示。
  • 平均灰度值(Mean Gray Value) - 选择区域内的平均灰度值。这是选择区域内所有像素的灰度值之和除以像素数。如果使用“分析>校准”对图像进行校准,则以校准单位(如光密度)报告。对于RGB图像,如果在“编辑>选项>转换”中勾选了“加权RGB转换”,则通过公式 gray=0.299red+0.587green+0.114*blue 将每个像素转换为灰度值来计算平均值;如果未勾选,则使用公式 gray=(red+green+blue)/3 计算平均值。
  • 标准偏差(Standard Deviation) - 用于生成平均灰度值的灰度值的标准偏差。
  • 模态灰度值(Modal Gray Value) - 选择区域内最频繁出现的灰度值。对应于直方图中的最高峰值。
  • 最小和最大灰度值(Min & Max Gray Value) - 选择区域内的最小和最大灰度值。
  • 质心(Centroid) - 选择区域的中心点。这是所有选择区域内像素的x和y坐标的平均值。
  • 重心(Center of Mass) - 这是所有选择区域内像素的亮度加权平均的x和y坐标。
  • 周长(Perimeter) - 选择区域外边界的长度。
  • 边界矩形(Bounding Rectangle) - 包围选择区域的最小矩形。使用BX、BY、宽度和高度作为标题,其中BX和BY是矩形左上角的坐标。
  • 拟合椭圆(Fit Ellipse) - 拟合一个椭圆到选择区域。使用主轴、次轴和角度作为标题。主轴和次轴是最佳拟合椭圆的主要和次要轴。
  • 角度(Angle) - 角度是主轴和图像x轴平行线之间的角度。请注意,如果像素纵横比在“设定比例”对话框中不是1.0,ImageJ无法计算主轴和次轴的长度。
  • 圆形度(Circularity) - 4pi(面积/周长^2)。值为1.0表示完美的圆形。当值接近0.0时,表示越来越细长的多边形。对于非常小的颗粒,值可能无效。对于小颗粒,由于在方格网中定义的周长和面积,圆形度可以大于1。在这些情况下,返回的值为1.0(在v1.37之前设定为-1.0)。
  • 费雷特直径(Feret’s Diameter) - 选择区域边界上任意两点之间的最长距离。也称为卡尺长度。费雷特直径宏将会在图像上绘制当前选择的费雷特直径。
  • 积分密度(Integrated Density) - 图像或选择区域内所有像素值的总和。这相当于面积和平均灰度值的乘积。点印迹分析示例演示了如何使用此选项分析点印迹试验。
  • 中位数(Median) - 图像或选择区域内像素的中位数。
  • 偏度(Skewness) - 关于均值的三阶矩。矩计算器插件的文档解释了如何解释空间矩。
  • 峰度(Kurtosis) - 关于均值的四阶矩。
  • 面积百分比(Area Fraction) - 使用“图像/调整/阈值”突出显示为红色的图像或选择区域内像素的百分比。对于非阈值图像,表示非零像素的百分比。
  • 限制阈值(Limit to Threshold) - 如果勾选,仅包括阈值内的像素进行测量计算。使用“图像>调整>阈值”设置阈值范围。
  • 显示标签(Display Label) - 如果勾选,图像名称和切片编号(对于堆叠)将在结果表的第一列中记录。
  • 反转Y坐标(Invert Y Coordinates) - 如果勾选,XY原点假定为图像窗口的左下角,而不是左上角。
  • 重定向到(Redirect To) - 从此弹出菜单中选择的图像将用作由测量和分析粒子命令进行统计计算的目标。重定向功能允许您在一张图像上勾画结构,并测量另一张图像中相应区域的强度。从ImageJ 1.35d或更高版本开始,该功能也适用于堆叠。
  • 小数位数(Decimal Places) - 这是结果表和直方图窗口中显示的实数的小数点右侧的位数。