这一期讲一讲imagej管道粗细的测量,使用的插件是Width Profile Tools,需要先下载IJPB-plugins,拥有MorphoLibJ,并将code复制到macros/toolsets里,就可以使用了。
插件官方网站地址:
中文安装指南
必须安装的插件
你必须安装 MorphoLibJ 插件。FIJI >> Help >> Update…>>Manage Update Sites 里面安装IJPB-plugins。
工具安装步骤
- 将
width_profile_tools.ijm
文件保存到 FIJI 安装目录下的macros/toolsets
文件夹中。 - 启动 FIJI 并从 >> 按钮中选择
width_profile_tools
工具集。
- 按下安装/更新按钮(带箭头的云)以安装工具,并在安装完成后重新启动 FIJI。
工具按钮说明
- 第一个按钮:打开此帮助页面。
- t 按钮:使用局部厚度插件计算宽度轮廓。
- v 按钮:使用对象轮廓两部分之间的 Voronoi 距离计算宽度轮廓。
- i 按钮:从垂直于对象惯性轴的线段计算宽度轮廓。
- c 按钮:从垂直于对象中心线的线段计算宽度轮廓。
工具菜单
-
utilities
菜单包含以下实用程序:- 选择中心线
- 平滑掩码图像
- 从包含一像素宽线的掩码图像创建线 ROI
- 在抑制厚度图像中的宽度后重新测量局部厚度
-
安装/更新按钮安装工具或将其更新到不同版本。
-
images
菜单允许下载示例数据集并打开数据集中的图像。